Можно ли создать несколько FTP-пользователей?

Да, конечно. Для создания дополнительного пользователя перейдите в панель управления ISPManager → раздел "Главное" → подраздел "FTP-пользователи" → иконка "Создать" → заполните поля → подтвердите добавление кнопкой "ОК".

Новому пользователю можно предоставить доступ ко всему аккаунту или только к отдельным каталогам.